Рефераты. Аллельные варианты генов-кандидатов подверженности туберкулезу у русского населения Западной Сибири






Примечание. р - достигнутый уровень значимости при сравнении частот аллелей и генотипов

У русских с ТБ и здоровых по сравнению с жителями Тувы чаще наблюдали гомозиготный по аллелею В и гетерозиготный генотипы. Среди жителей г. Томска, больных туберкулезом, по сравнению с тувинцами статистически значимо чаще встретились аллели 469+14C, 1465-85A, 274T гена NRAMP1, f гена VDR, и +3953А2 гена IL1В, реже регистрировались аллели 543N гена NRAMP1 и 1188С гена IL12B. В целом можно отметить, что отличия в распределении генотипов и аллелей между русскими и тувинцами были идентичными у больных и здоровых: у русских с туберкулезом преобладали те же аллели генов, что и у здоровых.

При сравнении распределений генотипов и частот аллелей в выборках больных и здоровых лиц, живущих в г. Томске и Томской области, выявлены статистически значимые отличия для полиморфизма 274С/Т гена NRAMP1 и трех генов, принимающих участие в продукции интерлейкинов (табл. 12). Так, у больных туберкулезом статистически значимо чаще регистрировался гетерозиготный генотип 274С/Т гена NRAMP1 (OR=1,66, 95%CI:1,02-2,71; p=0,040). Лица, обладающие гомозиготным генотипом 274С/C чаще встречались среди здоровых (OR=0,54, 95%CI:0,33-0,87; р=0,010). Показаны отличия частот аллелей у больных и здоровых для полиморфизма +3953 А1/А2 гена IL1B (p=0,036) за счет повышения доли аллеля А2 у больных туберкулезом. В тоже время, не найдено отличий при сравнении распределения генотипов этого полиморфизма гена IL1В (табл. 12).

Различия по VNTR полиморфизму гена IL1RN в выборках больных и здоровых касались как частот аллелей, так и частот генотипов. Аллель А2 статистически значимо чаще встречался у пациентов с туберкулезом. При сравнении частот генотипов выявлено более высокое количество гетерозигот А1/А2 у больных туберкулезом по сравнению с контролем (OR=2,10, 95%CI:1,26-3,51, р=0,003) (табл. 12). В противоположность этому у африканцев гетерозиготы по аллелю А2 IL1RN статистически значимо реже встречались у больных туберкулезом, чем в контрольной группе [Bellamy R., Ruwende C., 1998].

Найдена ассоциация полиморфизма 1188А/С гена IL12В с туберкулезом. Установлено, что распределение генотипов и частота аллелей в группах больных и здоровых различаются. В выборке больных статистически значимо чаще встречаются гомозиготы по аллелю 1188С (р=0,035). В данном случае вероятность заболеть туберкулезом обладателей гомозиготного генотипа 1188С/С значимо выше, чем у индивидов с гомозиготным генотипом 1188А/А и гетерозиготным (OR=8,31, 95%CI:1,15-169,30, р=0,030) (табл. 12). Несмотря на отклонение распределения генотипов от ожидаемого при РХВ полиморфизма B/b гена VDR у больных туберкулезом, не показано отличий между больными и здоровыми.

Диагноз туберкулеза устанавливается на основании наличия у больного характерных жалоб, эпидемиологического анамнеза, анамнеза заболевания, клинических симптомов, характерных изменений в общем анализе крови и рентгенологической картины. Однако только при обнаружении микобактерий туберкулеза (МБТ) в мокроте диагноз туберкулеза можно считать верифицированным [Рабухин А.Е.,1976].

Учитывая это, при дальнейшем анализе из общей группы больных была выделена выборка пациентов с бактериовыделением (МБТ+) (n=234). При сравнении распределения генотипов и частот аллелей в группах больных лабораторно подтвержденным туберкулезом и контрольной, найдены статистически значимые отличия для полиморфизма 274С/Т гена NRAMP1, аллельного варианта +3953 А1/А2 гена IL1B, VNTR полиморфизма гена IL1RN и полиморфизма 1188А/С IL12В (табл. 13). Частота аллеля 274Т гена NRAMP1 была выше в группе больных (р=0,009). Показана протективная роль генотипа 274С/С (OR=0,53, 95%CI: 0,32- 0,88, р=0,012).

Таблица 12 Статистические показатели для сравнения частот аллелей и генотипов у больных туберкулезом и здоровых

Ген

Полимор-физм

Гено-типы

Сравнение

OR (95%CI)

Генотипов р

Аллелей р

NRAMP1

469+14

G/C

GG

GC

CC

0,393

0,229

0,74 (0,46-1,18)

1,32 (0,83-2,13)

1,48 (0,27-10,77)

D543N

DD

DN

0,283

0,377

1,66 (0,70-3,88)

0,56 (0,24-1,34)

1465-85

G/A

GG

GA

AA

0,134

0,312

0,70 (0,45-1,08)

1,54 (0,99-2,41)

0,86 (0,42-1,76)

274C/T

CC

CT

TT

0,009

0,020

0,54* (0,33-0,87)

1,66* (1,02-2,71)

2,80 (0,59-18,13)

IL12B

1188

A/C

AA

AC

CC

0,035

0,044

0,72 (0,45-1,13)

1,12 (0,70-1,78)

8,31* (1,15-169,30)

VDR

B/b

BB

Bb

bb

0,925

0,791

0,94 (0,51-1,76)

0,96 (0,60-1,54)

1,10 (0,64-1,91)

F/f

FF

Ff

ff

0,705

0,469

1,20 (0,75-1,93)

0,89 (0,57-1,41)

0,88 (0,46-1,69)

IL1B

+3953

A1/A2

A1A1

A1A2

A2A2

0,108

0,036

0,70 (0,45-1,08)

1,21 (0,77-1,90)

2,32 (0,82-7,10)

IL1RN

VNTR

A1A1

A1A2

A2A2

0,030

0,023

0,57* (0,36-0,88)

2,10* (1,26-3,51)

0,97 (0,45-2,13)

Примечание. р - достигнутый уровень значимости; OR - величина отношения шансов; (95%CI) - доверительный интервал для OR; * - р < 0,05

Таблица 13 Статистические показатели для сравнения частот аллелей и генотипов у больных лабораторно подтвержденным туберкулезом и здоровых

Полимор-физм

Гено-тип

N

р

OR (95% СI)

Частота аллеля

р

NRAMP1

274С/Т

CC

CT

TT

126

94

12

0,021

0,53* (0,32-0,88)

1,64* (0,99-2,73)

3,11 (0,64-20,47)

C=0,746

0,009

IL12B

1188 А/С

AA

AC

CC

125

82

12

0,044

0,69 (0,43-1,11)

1,20 (0,74-1,94)

7,42* (0,99-154,58)

A=0,758

0,046

IL1B

+3953 А1/А2

A1A1

A1A2

A2A2

131

82

21

0,080

0,69 (0,44-1,09)

1,16 (0,73-1,87)

2,64 (0,91-8,21)

A1=0,735

0,036

IL1RN

VNTR

A1A1

A1A2

A2A2

другие

121

79

21

11

0,042

0,55* (0,35-0,87)

2,16* (1,28-3,68)

1,06 (0,48-2,38)

-

А1=0,707

A2=0,267

A3=0,024

A4=0,002

0,029

Страницы: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23



2012 © Все права защищены
При использовании материалов активная ссылка на источник обязательна.