Рефераты. Аллельные варианты генов-кандидатов подверженности туберкулезу у русского населения Западной Сибири






Результаты современных генетических исследований не оставили сомнений в существовании наследственной предрасположенности к туберкулезу [Хоменко А.Г., 1996; Чуканова В.П., 2001; Hill A.V.S., 1999]. Они показали, что одной из причин, определяющих такое разнообразие клинических проявлений, является полиморфизм генов, чьи продукты экспрессии вовлечены в патогенез заболевания. В то же время, пока не ясно, какие именно варианты генов имеют решающее значение. В связи с этим важно изучить вклад конкретных сочетаний аллелей в развитие болезни.

В исследованной выборке 304 больных туберкулезом русских жителей г. Томска и Томской области проанализировано распределение генотипов и частот аллелей полиморфизма генов NRAMP1, IL12B, VDR, IL1B, IL1RN (табл. 10). Выявлено отклонение наблюдаемого распределения генотипов полиморфизма B/b гена VDR от ожидаемого при РХВ (?2=6,95; р=0,008) за счет повышенной гетерозиготности (табл. 10). Учитывая неслучайный характер отбора индивидов в выборке, можно предположить наличие вероятного вклада гена VDR в патогенез туберкулеза. Для исследованных полиморфизмов генов NRAMP1, IL12B, IL1B, IL1RN в общей группе больных туберкулезом отклонение от РХВ не показано.

Известно, что у жителей Тувы больных туберкулезом выявлено отклонение от РХВ для полиморфизмов 1465-85G/A и D543N гена NRAMP1 за счет пониженного количества гетерозигот в обоих случаях и для полиморфизмов B/b и F/f гена VDR за счет повышенной гетерозиготности [Рудко А.А., 2004]. Таким образом, как для русских, так и для тувинцев, больных туберкулезом, характерно повышенное количество гетерозигот B/b гена VDR. Сравнение частот аллелей и генотипов у русских и тувинцев, больных туберкулезом, показало статистически значимые отличия для всех исследованных полиморфных маркеров (табл. 11). Максимальная степень отличий частот аллелей и генотипов показана для полиморфизма B/b гена VDR.

Таблица 10 Частоты аллелей и генотипов исследованных полиморфизмов у больных туберкулезом

Ген

Поли-морфизм

Гено-типы

N.O.

N.E.

Частота аллеля

?2

(d.f.)

Hobs

Hexp

D

NRAMP1

469+14

G/C

GG

GC

CC

179

94

6

183,07

85,86

10,07

G=

0,810

2,25

(1)

0,337

0,308

+0,095

D543N

DD

DN

NN

263

14

1

262,23

15,54

0,23

D=

0,971

1,28

(1)

0,050

0,056

-0,099

1465-85

G/A

GG

GA

AA

126

126

27

128,03

121,94

29,03

G=

0,677

0,25

(1)

0,452

0,437

+0,033

274C/T

CC

CT

TT

163

122

14

167,82

112,37

18,81

C=

0,749

2,01

(1)

0,408

0,376

+0,086

IL12B

1188

A/C

AA

AC

CC

162

100

17

161,09

101,82

16,09

A=

0,760

0,05

(1)

0,358

0,365

-0,018

VDR

B/b

BB

Bb

bb

49

168

76

60,37

145,26

87,37

b=

0,546

6,95*

(1)

0,573

0,496

+0,157

F/f

FF

Ff

ff

124

134

40

122,42

137,16

38,42

F=

0,641

0,12

(1)

0,450

0,460

-0,023

IL1B

+3953

A1/A2

A1A1

A1A2

A2A2

169

108

24

165,21

115,57

20,22

A1

0,741

1,16

(1)

0,359

0,384

-0,066

IL1RN

VNTR

A1A1

A1A2

A1A3

A1A4

A2A2

A2A3

другие

158

100

10

1

25

4

1

152,43

110,16

11,53

0,43

19,90

4,17

0,38

A1=

0,714

A2=

0,258

A3=

0,027

6,35

(6)

0,385

0,422

-0,088

Примечание. Обозначения см. табл. 6

Таблица 11 Сравнение частот аллелей и генотипов у русских и тувинцев с ТБ

Полимор-физм

Гено-типы

Частоты (%)

p

Ал-лели

Частоты

p

русские

тувинцы

русские

тувинцы

NRAMP1

469+14 G/C

GG

GC

CC

179 (64,2)

94 (33,7)

6 (2,1)

198 (85)

32 (13,7)

3 (1,3)

0,000

G

0,810

0,918

0,000

D543N

DD

DN

NN

263 (94,6)

14 (5)

1 (0,4)

191 (80,9)

39 (16,5)

6 (2,6)

0,000

D

0,971

0,892

0,000

1465-85G/A

GG

GA

AA

126 (45,2)

126 (45,2)

27 (9,6)

153 (65,7)

63 (27)

17 (7,3)

0,000

G

0,677

0,794

0,000

274C/T

CC

CT

TT

163 (54,5)

122 (40,8)

14 (4,7)

190 (80,5)

45 (19,1)

1 (0,4)

0,000

C

0,749

0,900

0,000

IL12B

1188 A/C

AA

AC

CC

162 (58)

100 (35,8)

17 (6,2)

90 (38,6)

102 (43,8)

41 (17,6)

0,000

A

0,760

0,605

0,000

VDR

B/b

BB

Bb

bb

49 (16,7)

168 (57,3)

76 (26)

3 (1,3)

82 (35)

149 (63,7)

0,000

b

0,546

0,812

0,000

F/f

FF

Ff

ff

124 (41,6)

134 (45)

40 (13,4)

125 (53,6)

102 (43,8)

6 (2,6)

0,000

F

0,641

0,755

0,000

IL1B

+3953 A1/A2

A1A1

A1A2

A2A2

169 (56,1)

108 (35,9)

24 (8)

185 (79,1)

47 (20)

2 (0,9)

0,000

A1

0,741

0,891

0,000

Страницы: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23



2012 © Все права защищены
При использовании материалов активная ссылка на источник обязательна.